蛋白降解

蛋白降解研究涵盖泛素–蛋白酶体系统(UPS)与自噬–溶酶体途径,是维持细胞蛋白稳态与信号重置的核心机制。我们提供泛素/连接酶、p97/VCP、自噬标志物及 PROTAC 相关读出工具,支持从基础降解调控到靶向降解(TPD)策略的探索。

重点研究方向:E3 底物识别与 CRL 动态、ERAD–p97 轴、选择性自噬受体、PROTAC/分子胶理性设计

蛋白降解相关抗体(精选)

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研究热点与方向

  • UPS 底物识别与时空控制:磷酸化/构象变化如何耦合到 SCF/CRL 的底物招募?
  • ERAD 与 p97/VCP 机器:错误折叠蛋白提取、去泛素化酶与蛋白酶体递送如何衔接?
  • 自噬流与选择性受体:p62、NDP52 等在泛素化 cargo 识别中的分工与冗余?
  • PROTAC 与靶向降解:三元复合物形成、E3 可配体性与组织选择性如何影响降解窗?

相关靶点

泛素化机器
UBE1/2/3 enzymes, RING/U-box/HECT ligases, HSP70/90 chaperones
蛋白酶体与调控
PSMA/B/C subunits, Rpn11/Rpn13, PA28/11S regulators (context)
自噬核心机器
ULK1 complex, PI3KC3-C1, ATG5–ATG12, LC3 conjugation system, TFEB/TFE3
TPD 相关 E3
CRBN, VHL, IAPs (cIAP1/2), DCAF15/DCAF16 (glue contexts; model-dependent)

相关信号通路

  1. Ub → E1 → E2 → E3 → substrate poly-Ub → 26S proteasome
    经典降解链;K48/K11 连接类型与链长影响识别与命运。
  2. ERAD: Hrd1/Sel1L–gp78–VCP modules
    内质网质量控制与病毒逃逸等课题交汇;需区分底物依赖性。
  3. Selective autophagy: Ub–receptor–LC3/LIR axis
    线粒体自噬、聚集体自噬等共享模块但受体组合不同。
  4. PROTAC: POI–PROTAC–E3 ternary complex → ubiquitination
    “可降解”与“可结合”不等价;需降解动力学与 off-tumor 评估。

相关抑制剂 / 工具分子(科研)

下列分子常用于机制研究与靶点验证;请以实验室 SOP、化合物说明书与伦理审批为准。

分子主要靶点/通路实验设计提示
MG132蛋白酶体(可逆性,常用工具)UPS 依赖降解验证常用;细胞毒性高,需严格剂量窗口与时间点。
Lactacystin蛋白酶体(不可逆,β 亚基相关)机制研究较“干净”的工具之一;仍具细胞毒性,注意对照。
MLN4924 (Pevonedistat)NEDDylation / NAE1CRL 激活轴常用干预点;需关注细胞周期与底物谱系差异。
Chloroquine溶酶体酸化(自噬流阻断)常与 BafA1 对照用于区分摄取 vs 降解步骤;心毒性文献需关注。
Bafilomycin A1V-ATPase / 溶酶体酸化阻断自噬体与溶酶体融合下游步骤;极低有效浓度,注意渗透载体。
3-MethyladeninePI3K class III(自噬起始相关)经典但多靶点;更适合作为粗筛而非单一机制结论依据。
CB-5083p97 / VCP ATPaseERAD 与应激颗粒等课题相关;注意线粒体与细胞死亡表型读出。