PI3K/Akt/mTOR · 靶点专题

ATG13

Autophagy-related protein 13(ATG13)

ATG13 是 PI3K/Akt/mTOR 信号通路上的 自噬/AMPK/DDR 与 mTOR 交叉。Autophagy factor required for autophagosome formation and mitophagy. Target of the TOR kinase signaling pathway that regulates autophagy through the control of the phosphorylation status of ATG13 and ULK1, and the regulation of the ATG13-ULK1-RB1CC1 complex. Through its regulatio… 在本站通路专题「ULK 复合物(mTORC1 负调控自噬起始)」小节中列出,便于检索抗体、抑制剂与实验读出。

研究要点

  • 与 ULK 复合物 其它节点联合遗传学或药理干预,可解析 ATG13 的非冗余贡献。
  • 解读 p-AKT、mTORC1/2 或脂质读出时,注释 PIK3CA/PTEN 及上游 RTK–Ras 背景。
  • WB/IP 前核对抗体克隆、磷酸化位点与刺激条件;建议包含 KD/KO 或抑制剂对照。

在本通路页面中的位置

遗传改变与表达语境(速查)

类型 / 示例结构域 / 语境(简述)
Expression context组织/细胞类型依赖表达
Rare variants散发病例需功能验证
Pathway coupling与 ATG13 相邻节点共现(见通路页)

命名与频率随队列与检测 panel 而异;临床解读请以 COSMIC、ClinVar、OncoKB 及检测机构注释为准,本站仅供科研参考。

ATG13 相关实验读出

  • 自噬:LC3-II、p62、ULK1 复合物磷酸化状态(mTORC1 抑制时增强)。
  • AMPK:p-ACC、p-TSC2(能量应激语境)。
  • DDR:γH2AX、CHK1/2 磷酸化(DNA 损伤模型)。
  • 与 Akt/mTOR 抑制剂联用解读平行存活通路。

ATG13 实验细节

以下为文献与公共资源(如 CCLE、DepMap)中常见的模型示例,仅供课题设计参考;具体基因型、表达量与传代请以数据库标注、测序及预实验为准。

【1】研究 ATG13 时常用的细胞株(示例)

  • 常见工具系:U2OS、MEFs、HEK293T、HCT116、A549——依 ATG13 表达与通路背景筛选(CCLE/DepMap)。
  • 与邻近节点(ULK1、ULK2、RB1CC1、ATG101)联合敲低/药理可解析非冗余性。
  • 过表达/回补:HEK293T 外源 ATG13 常用于机制与 IP 实验。
  • 等基因或 CRISPR 模型:区分“通路依赖”与旁路存活。

【2】哪些细胞样本适合做 ATG13 WB

  • 全细胞裂解:RIPA/NP-40 依抗体优化;磷酸化实验需磷酸酶抑制剂。
  • 刺激条件:血清饥饿后胰岛素/EGF 或氨基酸剥夺/回补(依基因功能)。
  • 对照:siRNA/shRNA、CRISPR KO 或药理抑制剂验证条带特异性。
  • 上样:BCA 定量、等量总蛋白;必要时核质分离。

【3】哪些组织样本适合做 ATG13 WB

  • 肿瘤与配对癌旁冻存组织:病理确认肿瘤含量后取材。
  • 小鼠模型:基因工程或异种移植瘤组织(注意种属抗体交叉)。
  • 原代细胞/PDC:伦理批准后验证细胞系结论。
  • FFPE 需专用提取;多数磷酸化研究优先冷冻组织。

【4】哪些细胞样本适合做 ATG13 IP

  • 标签过表达:HEK293T 转染 FLAG/HA-ATG13 便于复合物捕获。
  • 内源性 IP:选高表达细胞系;通常 1–5×10⁶ 细胞起(依抗体调整)。
  • 刺激:配体或营养处理可提高互作检出;预实验时间梯度。
  • 对照:同型 IgG、空载体、敲低/敲除阴性对照。

涉及人源组织与原代细胞须符合伦理与知情同意;肿瘤组织异质性强,建议记录病理分型、取材部位与保存条件。

旁路与关联通路

模型与遗传学提示

过表达与内源 ATG13 的剂量、剪接与区室定位可能不一致;类器官/PDX 建议记录传代、基质与药物暴露史。

站内检索预设

ATG13 相关抗体(关键词加权)

在 PI3K/Akt/mTOR 抗体池中叠加 ATG13 相关关键词加权;若空缺请改用上方预设或全站搜索。

常见问题

本站内容为科研试剂与信号通路教育信息,不构成医学诊断或治疗建议。突变注释、药物适应证与实验方案请以官方数据库、说明书及伦理审查为准。

内容审阅日期:2026-05-18

相关通路链接

同一主干上的其它靶点与读出详见 PI3K/Akt/mTOR 专题页;可与 MAPK、RTK、代谢与自噬页面交叉查阅。