细胞代谢整合葡萄糖摄取与糖酵解、线粒体三羧酸循环与氧化磷酸化、谷氨酰胺与脂肪酸等碳源利用,以及戊糖磷酸途径与一碳/核苷酸合成支路;AMPK 与 mTORC1 感知能量与营养可用性,HIF 等转录程序在缺氧时偏向糖酵解。肿瘤与慢性炎症中常见代谢重编程,与生长信号、免疫微环境及治疗抵抗耦联。
葡萄糖捕获与流量控制;PKM2 等亚型影响中间产物分支与核内非代谢功能(语境依赖)。
丙酮酸进入线粒体与乙酰辅酶A 供应;电子传递与 ATP 生成耦联氧化应激与生物合成前体。
谷氨酰胺回补、α-KG/2-HG 轴、胞质柠檬酸盐–乙酰辅酶A 与脂肪酸合成。
在上方概述基础上,按糖酵解与葡萄糖捕获、丙酮酸与 TCA、氧化磷酸化与 PPP、脂肪酸氧化与脂质合成、谷氨酰胺回补与氨基酸转运、AMPK/mTOR/HIF 感应及乳酸/NAD 平衡等模块列出 HGNC 符号。请以数据库与文献核对同工酶、复合物亚基与细胞模型差异。
代谢表型建议结合通量(耗氧率/胞外酸化)、稳定同位素示踪与靶向蛋白组;药物探针需记录浓度、时间与细胞密度依赖性。
| 模块 | 主要功能 | 典型读出 | 备注 |
|---|---|---|---|
| 糖酵解 | 快速 ATP、生物合成中间体、乳酸生成 | ECAR, 13C-lactate, HK2/PKM2 | Warburg 表型不等于“无氧化磷酸化”。 |
| TCA / OXPHOS | 高效 ATP、生物合成前体、NADH/FADH2 | OCR, 13C-glutamine TCA, TMRE | 培养基丙酮酸/谷氨酰胺浓度强烈影响表型。 |
| PPP | NADPH、核苷酸合成前体 | 6-AN(6-氨基烟酰胺)、13C1-葡萄糖分支示踪 | 氧化/非氧化分支需区分。 |
| 脂肪酸氧化 / 脂质合成 | β-氧化 ATP、NADH;棕榈酸等从头合成与膜脂供应 | Seahorse FAO 底物、CPT1 抑制(etomoxir,注意脱靶)、FASN/p-ACC | 肿瘤与肝脏模型对 FAO 依赖差异大。 |
| 谷氨酰胺回补 | α-KG 回补 TCA;支持生物合成与氧化还原平衡 | 13C5-谷氨酰胺示踪、GLS 抑制(BPTES/CB-839)、GOT1/2 | 部分细胞系“谷氨酰胺成瘾”并非普遍。 |
HK2、PFKL、ALDOA、PKM2、LDHA、GLUT1、MCT1/4、PDK1、PDH、IDH1/2、ACLY、FASN、GLS、AMPKα、p-AMPK、mTOR、p-S6K、p-S6、HIF1α 等;WB、IHC、IF、流式依克隆选择。
己糖激酶、LDH、谷氨酰胺酶等重组蛋白用于体外酶活或下拉实验(视库存)。
葡萄糖摄取、乳酸、ATP、NAD/NADH 比色或荧光试剂盒;遵循说明书与伦理审批。
科研用途;请遵循实验室 SOP、化合物说明书与伦理审批。部分为通量探针而非特异治疗药物。
己糖激酶底物类似物;糖酵解通量常用探针。
ATP 合酶抑制剂;Seahorse OCR 对照。
谷氨酰胺酶(GLS)抑制剂;谷氨酰胺依赖模型。
CPT1 / 脂肪酸氧化探针(注意脱靶)。
线粒体复合物 I 相关效应;AMPK 语境研究常用。
mTORC1 抑制;注意反馈激活 PI3K/Akt。
LDH 抑制工具;乳酸/NAD+ 平衡实验。
突变 IDH1 抑制剂(课题/注册状态依从)。
代谢网络并非孤立的基础生理功能,而与染色质修饰、细胞周期检查点及免疫受体信号广泛交联;同一基因产物可在胞质与核内承担不同调控角色。
肿瘤代谢经典
通路整合与综述