细胞代谢信号通路

细胞代谢整合葡萄糖摄取与糖酵解、线粒体三羧酸循环与氧化磷酸化、谷氨酰胺与脂肪酸等碳源利用,以及戊糖磷酸途径与一碳/核苷酸合成支路;AMPK 与 mTORC1 感知能量与营养可用性,HIF 等转录程序在缺氧时偏向糖酵解。肿瘤与慢性炎症中常见代谢重编程,与生长信号、免疫微环境及治疗抵抗耦联。

1. 相关靶点

核心节点

  • GLUT / HK / PFK / PKM

    葡萄糖捕获与流量控制;PKM2 等亚型影响中间产物分支与核内非代谢功能(语境依赖)。

  • PDH / TCA / ETC

    丙酮酸进入线粒体与乙酰辅酶A 供应;电子传递与 ATP 生成耦联氧化应激与生物合成前体。

  • GLS / IDH / ACLY / FASN

    谷氨酰胺回补、α-KG/2-HG 轴、胞质柠檬酸盐–乙酰辅酶A 与脂肪酸合成。

感应与整合

  • AMPK:AMP/ADP 上升、Ca2+、LKB1 等上游
  • mTORC1:氨基酸、葡萄糖、生长因子与 Rag/Rheb
  • HIF1A:脯氨酰羟化酶–VHL–蛋白酶体轴

输出与转运

  • LDH–乳酸–MCT:维持 NAD+ 循环与微环境酸化
  • NADPH:PPP、苹果酸酶、叶酸/一碳支路(模型依赖)

补充:代谢相关靶点(基因符号)

在上方概述基础上,按糖酵解与葡萄糖捕获、丙酮酸与 TCA、氧化磷酸化与 PPP、脂肪酸氧化与脂质合成、谷氨酰胺回补与氨基酸转运、AMPK/mTOR/HIF 感应及乳酸/NAD 平衡等模块列出 HGNC 符号。请以数据库与文献核对同工酶、复合物亚基与细胞模型差异。

葡萄糖摄取与糖酵解

葡萄糖摄取与己糖激酶

GLUT 家族与 HK 同工酶决定葡萄糖捕获与通量入口。

SLC2A1, SLC2A2, SLC2A3, SLC2A4, HK1, HK2, HK3, GPI, PFKM, PFKL, PFKP, ALDOA, ALDOB, ALDOC

糖酵解核心酶(流量与分支)

PKM 亚型与下游乳酸/生物合成分支密切相关。

TPI1, GAPDH, PGK1, PGAM1, PGAM2, ENO1, ENO2, ENO3, PKM, PKLR, PDK1, PDK2, PDK3, PDK4

丙酮酸脱氢酶与 TCA

丙酮酸脱氢酶与乙酰辅酶A 入口

PDHA1, PDHA2, PDHB, DLAT, DLD, PDHX, PDPR, PDP1, PDP2

三羧酸循环(TCA)

CS, ACO1, ACO2, IDH1, IDH2, IDH3A, IDH3B, IDH3G, OGDH, DLST, SUCLG1, SUCLG2, SUCLA2, SDHA, SDHB, SDHC, SDHD, FH, MDH1, MDH2, PC, PCK1, PCK2

氧化磷酸化与 PPP / 一碳

氧化磷酸化(ETC / ATP 合酶代表)

线粒体复合物基因众多,此处列常用读出代表。

NDUFS1, NDUFS3, UQCRC2, CYCS, COX4I1, COX5A, ATP5F1A, ATP5F1B, ATP5F1C, SLC25A1, SLC25A5

戊糖磷酸途径与一碳/叶酸相关(代表)

NADPH 与核苷酸前体;与叶酸循环存在交叉。

G6PD, PGD, TALDO1, TKT, RPIA, RPE, MTHFD1, MTHFD2, SHMT1, SHMT2, DHFR, TYMS

脂肪酸氧化与脂质合成

脂肪酸氧化(线粒体 β-氧化入口代表)

CPT1A, CPT1B, CPT1C, CPT2, ACADVL, ACADM, HADHA, HADHB, EHHADH, ACADS, ACAA2

脂肪酸与脂质合成

ACLY, ACACA, ACACB, FASN, SCD, ELOVL6, AGPAT1, GPAM, DGAT1, DGAT2, LPIN1

谷氨酰胺酶、回补与溶质载体

谷氨酰胺酶与回补(anaplerosis)

GLS, GLS2, GLUD1, GLUD2, GOT1, GOT2, GPT, GPT2, MDH1, MDH2

溶质载体:葡萄糖、乳酸、氨基酸(代表)

SLC2A1, SLC16A1, SLC16A3, SLC16A7, SLC1A5, SLC7A5, SLC7A11, SLC38A1, SLC38A2

AMPK、mTOR 与 HIF

乳酸脱氢酶与苹果酸酶

乳酸脱氢酶与苹果酸酶(NADH/NADPH)

LDHA, LDHB, LDHC, ME1, ME2, ME3, MDH1, MDH2

2. 推荐实验读出

代谢表型建议结合通量(耗氧率/胞外酸化)、稳定同位素示踪与靶向蛋白组;药物探针需记录浓度、时间与细胞密度依赖性。

  • Seahorse:OCR / ECAR;寡霉素、FCCP、鱼藤酮/抗霉素 A 对照顺序
  • 13C6-葡萄糖或 13C5-谷氨酰胺示踪—糖酵解/TCA/回补通量
  • 胞外乳酸、葡萄糖摄取(2-NBDG 等)、胞内 ATP/ADP 比值(方法学敏感)
  • p-AMPKα、p-ACC、磷酸化 S6K / p-S6(mTORC1 读出)
  • HK2、PKM2、LDHA、GLS、ACLY、FASN、IDH1/2 总蛋白与亚细胞分级(依课题)

3. 主要碳流模块对照

模块主要功能典型读出备注
糖酵解快速 ATP、生物合成中间体、乳酸生成ECAR, 13C-lactate, HK2/PKM2Warburg 表型不等于“无氧化磷酸化”。
TCA / OXPHOS高效 ATP、生物合成前体、NADH/FADH2OCR, 13C-glutamine TCA, TMRE培养基丙酮酸/谷氨酰胺浓度强烈影响表型。
PPPNADPH、核苷酸合成前体6-AN(6-氨基烟酰胺)、13C1-葡萄糖分支示踪氧化/非氧化分支需区分。
脂肪酸氧化 / 脂质合成β-氧化 ATP、NADH;棕榈酸等从头合成与膜脂供应Seahorse FAO 底物、CPT1 抑制(etomoxir,注意脱靶)、FASN/p-ACC肿瘤与肝脏模型对 FAO 依赖差异大。
谷氨酰胺回补α-KG 回补 TCA;支持生物合成与氧化还原平衡13C5-谷氨酰胺示踪、GLS 抑制(BPTES/CB-839)、GOT1/2部分细胞系“谷氨酰胺成瘾”并非普遍。

4. 肿瘤与微环境:代谢重编程

  • 营养竞争:葡萄糖/谷氨酰胺限制下,肿瘤细胞与免疫细胞代谢偏好可相互塑造。
  • 乳酸与酸性微环境:MCT 介导的乳酸穿梭影响邻近细胞功能与药物渗透。
  • 靶向代谢的耐药:旁路酶上调、线粒体可塑性、自噬增强等可补偿单一代谢抑制。

细胞代谢相关抗体(精选)

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5. 产品线说明与站内检索

一抗与修饰抗体

HK2、PFKL、ALDOA、PKM2、LDHA、GLUT1、MCT1/4、PDK1、PDH、IDH1/2、ACLY、FASN、GLS、AMPKα、p-AMPK、mTOR、p-S6K、p-S6、HIF1α 等;WB、IHC、IF、流式依克隆选择。

重组蛋白 / 酶

己糖激酶、LDH、谷氨酰胺酶等重组蛋白用于体外酶活或下拉实验(视库存)。

检测与试剂盒

葡萄糖摄取、乳酸、ATP、NAD/NADH 比色或荧光试剂盒;遵循说明书与伦理审批。

6. 抑制剂与工具化合物(汇总)

科研用途;请遵循实验室 SOP、化合物说明书与伦理审批。部分为通量探针而非特异治疗药物。

2-Deoxy-D-glucose (2-DG)

己糖激酶底物类似物;糖酵解通量常用探针。

Oligomycin

ATP 合酶抑制剂;Seahorse OCR 对照。

BPTES / CB-839

谷氨酰胺酶(GLS)抑制剂;谷氨酰胺依赖模型。

Etomoxir

CPT1 / 脂肪酸氧化探针(注意脱靶)。

Metformin

线粒体复合物 I 相关效应;AMPK 语境研究常用。

Rapamycin / Torin1

mTORC1 抑制;注意反馈激活 PI3K/Akt。

Oxamate

LDH 抑制工具;乳酸/NAD+ 平衡实验。

AGI-5198 / Ivosidenib class

突变 IDH1 抑制剂(课题/注册状态依从)。

7. 通路示意图

细胞代谢(简化示意)
细胞代谢信号通路示意图
通路图说明
  1. 葡萄糖经 GLUT 进入糖酵解,丙酮酸–乳酸支路
  2. 线粒体 TCA 与氧化磷酸化耦联 ATP 与 ROS
  3. 谷氨酰胺回补与 IDH 等节点影响 α-KG/2-HG
  4. AMPK 与 mTORC1 整合营养与生长信号

8. 通路生物学简介

代谢网络并非孤立的基础生理功能,而与染色质修饰、细胞周期检查点及免疫受体信号广泛交联;同一基因产物可在胞质与核内承担不同调控角色。

  • 组织与细胞类型决定基线通量,跨模型外推需谨慎
  • 培养条件(血清、氧气、底物)是代谢表型的第一变量

11. 参考文献

肿瘤代谢经典

  • • Warburg O. (1956). Science. 123(3191):309-14.
  • • Vander Heiden MG, Cantley LC, Thompson CB. (2009). Science. 324(5930):1029-33.

通路整合与综述

  • • DeBerardinis RJ, Thompson CB. (2012). Cell. 148(6):1132-44.
  • • Martinez-Reyes I, Chandel NS. (2020). Nat Rev Mol Cell Biol. 21(12):710-27.