PI3K/Akt/mTOR · 靶点专题

PIK3C3

Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3（PIK3C3）

PIK3C3 是 PI3K/Akt/mTOR 信号通路上的 PI3K 脂质激酶/调节模块。Catalytic subunit of the PI3K complex that mediates formation of phosphatidylinositol 3-phosphate; different complex forms are believed to play a role in multiple membrane trafficking pathways: PI3KC3-C1 is involved in initiation of autophagosomes and PI3KC3-C2 in maturation of a… 在本站通路专题「III 型 PI3K（Vps34 复合物，自噬/内吞与氨基酸感应交叉）」小节中列出，便于检索抗体、抑制剂与实验读出。

站内搜索：PIK3C3 返回通路总览 UniProt (Q8NEB9)

研究要点

与 III 型 PI3K 其它节点联合遗传学或药理干预，可解析 PIK3C3 的非冗余贡献。
解读 p-AKT、mTORC1/2 或脂质读出时，注释 PIK3CA/PTEN 及上游 RTK–Ras 背景。
WB/IP 前核对抗体克隆、磷酸化位点与刺激条件；建议包含 KD/KO 或抑制剂对照。

在本通路页面中的位置

III 型 PI3K（Vps34 复合物，自噬/内吞与氨基酸感应交叉）class3-pi3k

遗传改变与表达语境（速查）

类型 / 示例	结构域 / 语境（简述）
Expression context	组织/细胞类型依赖表达
Rare variants	散发病例需功能验证
Pathway coupling	与 PIK3C3 相邻节点共现（见通路页）

命名与频率随队列与检测 panel 而异；临床解读请以 COSMIC、ClinVar、OncoKB 及检测机构注释为准，本站仅供科研参考。

PIK3C3 相关实验读出

脂质侧：PIP₃/PI(3,4)P₂ 探针或 PH 结构域 pull-down；区分 PIK3C3 与 class II/III PI3K 区室。
生化：IP–脂质激酶或膜募集；配对 p85/调节亚基共沉淀。

下游：p-AKT Thr308/Ser473、p-S6K、p-4E-BP1；总蛋白与刺激/抑制剂曲线。
遗传：PTEN/INPP4 状态；NGS 或 ddPCR 注释突变与拷贝数。

PIK3C3 实验细节

以下为文献与公共资源（如 CCLE、DepMap）中常见的模型示例，仅供课题设计参考；具体基因型、表达量与传代请以数据库标注、测序及预实验为准。

【1】研究 PIK3C3 时常用的细胞株（示例）

常见工具系：HEK293T、MCF-7、HCT116、Jurkat、U937——依 PIK3C3 表达与通路背景筛选（CCLE/DepMap）。
与邻近节点（VPS15、NRBF2、BECN1、ATG14）联合敲低/药理可解析非冗余性。
过表达/回补：HEK293T 外源 PIK3C3 常用于机制与 IP 实验。
等基因或 CRISPR 模型：区分“通路依赖”与旁路存活。

【2】哪些细胞样本适合做 PIK3C3 WB

全细胞裂解：RIPA/NP-40 依抗体优化；磷酸化实验需磷酸酶抑制剂。
刺激条件：血清饥饿后胰岛素/EGF 或氨基酸剥夺/回补（依基因功能）。
对照：siRNA/shRNA、CRISPR KO 或药理抑制剂验证条带特异性。
上样：BCA 定量、等量总蛋白；必要时核质分离。

【3】哪些组织样本适合做 PIK3C3 WB

肿瘤与配对癌旁冻存组织：病理确认肿瘤含量后取材。
小鼠模型：基因工程或异种移植瘤组织（注意种属抗体交叉）。
原代细胞/PDC：伦理批准后验证细胞系结论。
FFPE 需专用提取；多数磷酸化研究优先冷冻组织。

【4】哪些细胞样本适合做 PIK3C3 IP

标签过表达：HEK293T 转染 FLAG/HA-PIK3C3 便于复合物捕获。
内源性 IP：选高表达细胞系；通常 1–5×10⁶ 细胞起（依抗体调整）。
刺激：配体或营养处理可提高互作检出；预实验时间梯度。
对照：同型 IgG、空载体、敲低/敲除阴性对照。

涉及人源组织与原代细胞须符合伦理与知情同意；肿瘤组织异质性强，建议记录病理分型、取材部位与保存条件。

蛋白参考 · 序列与修饰

种属间序列保守性（相对人源）

种属	UniProt	长度	与人同一性
人 Homo sapiens	Q8NEB9	887	100%
小鼠 Mus musculus	Q6PF93	887	98.0%
大鼠 Rattus norvegicus	O88763	887	98.1%
猪 Sus scrofa	Q5D891	887	98.5%
鸡 Gallus gallus	A0A3Q2UEL4	886	94.1%
爪蟾 Xenopus laevis	Q6AZN6	886	92.0%
斑马鱼 Danio rerio	A0A8M9QGZ6	887	86.5%
果蝇 Drosophila melanogaster	Q9W1M7	949	56.7%
线虫 Caenorhabditis elegans	Q9TXI7	901	40.0%
酵母 Saccharomyces cerevisiae	P22543	875	38.5%

同一性为与人源 UniProt Q8NEB9 全长全局比对（Needleman–Wunsch）的同源残基占比。鸡、斑马鱼、果蝇为 UniProt 未审阅条目；位点编号与功能注释请以各登录号及文献为准。

蛋白序列（人）

人 Homo sapiensQ8NEB9887 aa

结构域示意（UniProt）

L29 L34 L132 T159 T163 S165 S244 S249 S261 S282 M617 T668 T677 L771 L840 L845

C2（PI3K-type） 35–184
PIK helical 283–520
PI3K/PI4K catalytic 605–871
关键 loop / 功能区
修饰位点（圆点 / 芯片可点至表）

        10        20        30        40        50        60
MGEAEKFHYIYSCDLDINVQLKIGSLEGKREQKSYKAVLEDPMLKFSGLYQETCSDLYVT
        70        80        90       100       110       120
CQVFAEGKPLALPVRTSYKAFSTRWNWNEWLKLPVKYPDLPRNAQVALTIWDVYGPGKAV
       130       140       150       160       170       180
PVGGTTVSLFGKYGMFRQGMHDLKVWPNVEADGSEPTKTPGRTSSTLSEDQMSRLAKLTK
       190       200       210       220       230       240
AHRQGHMVKVDWLDRLTFREIEMINESEKRSSNFMYLMVEFRCVKCDDKEYGIVYYEKDG
       250       260       270       280       290       300
DESSPILTSFELVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIV
       310       320       330       340       350       360
SYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGKWKPMDV
       370       380       390       400       410       420
EDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKK
       430       440       450       460       470       480
DSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLI
       490       500       510       520       530       540
SRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRS
       550       560       570       580       590       600
LLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVK
       610       620       630       640       650       660
IRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTEDGGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRK
       670       680       690       700       710       720
ENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQSVPVAEVLDTEGSIQNFFRKYAPSENGPNGISAE
       730       740       750       760       770       780
VMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGRDPKPLPPPMKLN
       790       800       810       820       830       840
KEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVK
       850       860       870       880       
KVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK

Canonical isoform（UniProt Q8NEB9）；单字母氨基酸序列。剪接异构体与冲突位点以 UniProt 条目为准。

翻译后修饰（磷酸化及其他）

位点	修饰类型	说明
磷酸化10
Thr159	磷酸化（Phosphothreonine）	CDK1 / CDK5；抑制与 Beclin-1 互作及脂质激酶活性，有丝分裂期下调自噬（PubMed:20513426）。
Thr163	磷酸化（Phosphothreonine）	AMPK；与 Ser165 协同抑制非自噬型 VPS34 复合物（营养/能量应激）。UniProt 收录。
Ser165	磷酸化（Phosphoserine）	AMPK；与 Thr163 配对的抑制性磷酸化。UniProt 收录。
Ser244	磷酸化（Phosphoserine）	UniProt 收录（种属旁证）；大规模磷酸化组学常见。
Ser249	磷酸化（Phosphoserine）	ULK1/2/3（dbPTM/PhosphoSitePlus）；自噬起始语境下的上游磷酸化。
Ser261	磷酸化（Phosphoserine）	UniProt / 大规模分析（如 PubMed:19369195）。
Ser282	磷酸化（Phosphoserine）	UniProt / 大规模分析（如 PubMed:23186163）。
Thr668	磷酸化（Phosphothreonine）	CDK5；位于催化域附近，可直接抑制活性（PubMed:20513426）。
Thr677	磷酸化（Phosphothreonine）	PKD（PRKD1）催化域位点之一；促进 PI3P 生成与自噬体形成（PubMed:22095288）。
Tyr (Src)	酪氨酸磷酸化	Src 家族介导的酪氨酸磷酸化可增强脂质激酶活性（胰岛素等语境；PubMed:24582588）。精确位点依实验体系核对。
其他修饰4
Lys29 / Lys771（主）；Lys34 / Lys132 等	乙酰化（Acetylation）	功能研究以 EP300/p300 介导的 Lys29、Lys771 为主（Mol Cell 2017，PubMed:28844862）：K29 乙酰化妨碍 VPS34–Beclin 1 核心复合物组装，K771 降低对 PI 底物亲和力。Lys34、Lys132 等多为 dbPTM/高通量收录。目前未见商业化抗 Ac-K29 / Ac-K771–VPS34 位点专一抗体。检测方法：文献常用：抗乙酰赖氨酸（pan-Ac-K）抗体检测 VPS34 IP 产物（WB）；位点鉴定靠 LC-MS/MS；功能验证用 K→R 突变体。
Lys (polyUb)	泛素化	UBE3C 写 K29/K48 链促降解；ZRANB1/TRABID 去泛素化可稳定蛋白（PubMed:33637724）。Cul3–KLHL20 亦可泛素化噬集体上的 VPS34 以终止自噬（PubMed:26687681）。
Lys840（主）/ Lys845	SUMO 化（Sumoylation）	Lys840 经 KAP1 连接 SUMO1，促进与乙酰化 HSP70 及 Beclin 1 互作、增强自噬（PNAS 2013，doi:10.1073/pnas.1217692110）。Lys845 多为数据库次级标注。未见商业化抗 SUMO-K840–VPS34 位点专一抗体。检测方法：文献：抗 SUMO1（如 Invitrogen）与抗 Vps34（如 Echelon）共 IP/WB 或 IF 共定位；His-SUMO1 拉下；位点由质谱鉴定，K840R 突变验证。
Met617	甲硫氨酸氧化（Sulfoxidation）	dbPTM 收录的 Met 亚砜化位点；证据来自氧化还原蛋白组学（MCP 2011，PubMed:21406390：H₂O₂ 处理 Jurkat 细胞的定量 MetO 图谱），并非位点专一抗体研究。未见商业化抗 Met617-ox–PIK3C3 抗体。检测方法：位点鉴定与定量：LC-MS/MS 氧化还原蛋白组学。泛 MetO 抗体可用于总蛋白氧化筛查，但不能特异读出 Met617。

优先列出有激酶/功能注释的位点（SIGNOR、UniProt、关键文献），并选录 dbPTM 中的乙酰化、泛素化、SUMO、氧化等。非磷酸化位点若标注「检测方法」，多为文献常用的泛修饰抗体 + IP / 质谱 / 突变验证——目前少见商品化位点专一抗体。质谱高通量磷酸化位点（如 Ser25、Ser448/455 等）数量较多，完整目录见 dbPTM / PhosphoSitePlus；抗体 epitope 映射前请核对种属编号与刺激条件。

旁路与关联通路

模型与遗传学提示

过表达与内源 PIK3C3 的剂量、剪接与区室定位可能不一致；类器官/PDX 建议记录传代、基质与药物暴露史。

站内检索预设

PIK3C3 PIK3C3 抗体 PI3K 抑制剂 mTOR 抑制剂

PIK3C3 相关抗体（关键词加权）

在 PI3K/Akt/mTOR 抗体池中叠加 PIK3C3 相关关键词加权；若空缺请改用上方预设或全站搜索。

同通路邻近靶点

VPS15 NRBF2 BECN1 ATG14 UVRAG RUBCN RUBCNL SH3GLB1

外部数据库与资源

常见问题

本站内容为科研试剂与信号通路教育信息，不构成医学诊断或治疗建议。突变注释、药物适应证与实验方案请以官方数据库、说明书及伦理审查为准。

内容审阅日期：2026-09-04